# Variables socles pour les EDSH - Data Management with FHIR v0.1.0

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* [CareSite OMOP Table](StructureDefinition-OMOPCareSite.md)
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* [Episode OMOP Table](StructureDefinition-OMOPEpisode.md)
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* [Visit Detail OMOP Table](StructureDefinition-OMOPVisitDetail.md)
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* [Questionnaire usage Variables socles pour les EDSH](Questionnaire-UsageCore.md)
* [Profil de Claim pour le champ MCO du PMSI](StructureDefinition-DMClaimPMSIMCO.md)
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* [Alanine aminotransférase (ALAT)](StructureDefinition-DMObservationLaboratoryALAT.md)
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* [Consommation de tabac](StructureDefinition-DMObservationSmokingStatus.md)
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* [Eosinophiles](StructureDefinition-DMObservationLaboratoryEosinophiles.md)
* [Episode of care](StructureDefinition-DMEpisodeOfCare.md)
* [Erythrocytes](StructureDefinition-DMObservationLaboratoryErythrocytes.md)
* [Fonction rénale](StructureDefinition-DMObservationLaboratoryFonctionRenale.md)
* [French branded name Medication](StructureDefinition-FrMedicationUcd.md)
* [French compound Medication](StructureDefinition-FrMedicationCompound.md)
* [French non proprietary name Medication](StructureDefinition-FrMedicationNonproprietaryName.md)
* [French Ucd Part Medication](StructureDefinition-FrMedicationUcdPart.md)
* [Gamma-glutamyl transférase (GGT)](StructureDefinition-DMObservationLaboratoryGGT.md)
* [Glycémie à jeun](StructureDefinition-DMObservationLaboratoryGlycemieAJeun.md)
* [Hématocrite](StructureDefinition-DMObservationLaboratoryHematocrite.md)
* [Hémoglobine](StructureDefinition-DMObservationLaboratoryHemoglobine.md)
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* [Plaquettes](StructureDefinition-DMObservationLaboratoryPlaquettes.md)
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* [Practitioner](StructureDefinition-DMPractitioner.md)
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* [Prescription de médicaments](StructureDefinition-DMMedicationRequest.md)
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* [Procedure](StructureDefinition-DMProcedure.md)
* [RUM du PMSI MCO](StructureDefinition-DMClaimRUM.md)
* [Taille du patient](StructureDefinition-DMObservationBodyHeight.md)
* [Taux prothrombine (TP)](StructureDefinition-DMObservationLaboratoryTP.md)
* [Temps de céphaline activée (TCA)](StructureDefinition-DMObservationLaboratoryTCA.md)
* [Urée](StructureDefinition-DMObservationLaboratoryUremie.md)
* [Volume globulaire moyen](StructureDefinition-DMObservationLaboratoryVGM.md)
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* [Range with UCUM quantity units](StructureDefinition-FrRangeUcum.md)
* [Ratio with UCUM quantity units](StructureDefinition-FrRatioUcum.md)
* [SimpleQuantity with UCUM quantity unit](StructureDefinition-FrSimpleQuantityUcum.md)
* [Codage géographique du lieu de résidence pour les RSA du PMSI](StructureDefinition-PmsiCodeGeo.md)
* [Groupe Homogène de Malade](StructureDefinition-DRG.md)
* [Ordre des Item dans un claim](StructureDefinition-ItemRank.md)
* [Source ayant fournie l'information de décès](StructureDefinition-DeathSource.md)
* [Actes CCAM pour le PMSI](ValueSet-CcamVS.md)
* [Blood Pressure Measurement Body Location Precoordinated](ValueSet-BloodPressureMeasurementBodyLocationPrecoodinated.md)
* [Blood Pressure Measurement Method](ValueSet-BloodPressureMeasurementMethod.md)
* [Categorisation des items de claim pour le PMSI MCO](ValueSet-FrMCOClaimItemCategory.md)
* [Exercice Status Type](ValueSet-DMExerciceStatusType.md)
* [French Medicinal product Dose form](ValueSet-FrMpDoseForm.md)
* [French Medicinal Product only](ValueSet-FrMedicinalProductOnly.md)
* [French Route of Administration](ValueSet-FrRouteOfAdministration.md)
* [Height Length Measurement Method](ValueSet-HeightLengthMeasurementMethod.md)
* [Liste des analyses biologiques socle des EDS](ValueSet-DMLaboratory.md)
* [Liste des analyses correspondant à l'estimation du DFG - socle des EDS](ValueSet-DMLaboratoryEstimatedDFG.md)
* [Liste des diagnostiques CIM-10 acceptable en DA pour les PMSI MCO et HAD](ValueSet-CIM10PMSIDA.md)
* [Liste des diagnostiques CIM-10 acceptable en DP pour les PMSI MCO et HAD](ValueSet-CIM10PMSIDP.md)
* [Liste des diagnostiques CIM-10 acceptable en DR pour les PMSI MCO et HAD](ValueSet-CIM10PMSIDR.md)
* [Liste des diagnostiques CIM-10 OMS](ValueSet-CIM10.md)
* [Liste des diagnostiques CIM-10 pour le PMSI](ValueSet-CIM10PMSI.md)
* [Liste des GHM pour le PMSI MCO](ValueSet-GHMVS.md)
* [Liste des status pour l'Observation de consommation de tabac](ValueSet-DMObservationSmokingStatusStatus.md)
* [Liste des unités possibles pour une estimation du débit de filtration glomérulaire - socle des EDS](ValueSet-DMLaboratoryEstimatedDFGUnit.md)
* [Mode d'entré du PMSI MCO](ValueSet-PMSIMCOMDEVS.md)
* [Mode de sortie du PMSI MCO](ValueSet-PMSIMCOMDSVS.md)
* [Smoking status comprehensive](ValueSet-DMSmokingStatusComprehensive.md)
* [Smoking Status Pack Years SCT](ValueSet-DMSmokingStatusPackYearsSCT.md)
* [Smoking Status Type](ValueSet-DMSmokingStatusType.md)
* [Smoking Status Type from LOINC](ValueSet-DMSmokingStatusTypeLOINC.md)
* [ValueSet des codes géographiques de résidence du PMSI](ValueSet-PmsiCodeGeoVs.md)
* [ValueSet des modes d'entrée du DPI](ValueSet-DpiModeIn.md)
* [ValueSet des modes de sortie du DPI](ValueSet-DpiModeOut.md)
* [ValueSet des Sexe administratif du DPI](ValueSet-DpiGenderVS.md)
* [ValueSet des sources d'informations fr sur le statut vital](ValueSet-DeathSourcesVs.md)
* [ValueSet des type fr des claims](ValueSet-FrClaimType.md)
* [ValueSet des type fr des claims](ValueSet-FrMCOClaimSubType.md)
* [ValueSet des types de séjour du DPI](ValueSet-DpiEncounterTypeVS.md)
* [ValueSet of gender of OHDSI](ValueSet-OMOPGender.md)
* [Weight Measurement Method](ValueSet-WeightMeasurementMethod.md)
* [Cadre de facturation dans la réglementation française](CodeSystem-FrClaimType.md)
* [Categorie d'information pour les supporting information](CodeSystem-FrClaimSupInfoCategoryPMSIMCO.md)
* [Categorisation des items de claim pour le PMSI MCO](CodeSystem-FrMCOClaimItemCategory.md)
* [CCAM illustrative](CodeSystem-Ccam.md)
* [CIM 10 PMSI](CodeSystem-CIM10.md)
* [Classification des GHM utilisée pour le groupage des séjours dans le PMSI MCO.](CodeSystem-GHM.md)
* [CodeSystem des lieux de résidence géographique au sens du PMSI](CodeSystem-PmsiCodeGeo.md)
* [DPI Gender](CodeSystem-DpiGender.md)
* [Dpi Mode d'entrée](CodeSystem-DpiModeIn.md)
* [Dpi Mode de sortie](CodeSystem-DpiModeOut.md)
* [DPI Type de séjour](CodeSystem-DpiEncounterType.md)
* [Mode d'entré du PMSI MCO](CodeSystem-PMSIMCOMDE.md)
* [Mode de sortie du PMSI MCO](CodeSystem-PMSIMCOMDS.md)
* [mode PMSI](CodeSystem-FrClaimMode.md)
* [Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP)](CodeSystem-dm-omop-cdm-v20240229.md)
* [SNOMED CT Solor Extension Temporary](CodeSystem-SolorTemporary.md)
* [Sources susceptibles d'informer sur le statu vital des patients](CodeSystem-DeathSources.md)
* [Specialités médicales au sens de la Fédération des Spécialités Médicales (FSM)](CodeSystem-SpecialitesMedicalesFSM.md)
* [type de diagnostic du PMSI MCO](CodeSystem-PMSIMCODiagType.md)
* [Transforms EHR logical model data to FHIR Semantic Layer resources using Bundle as container](StructureMap-EHR2FSL.md)
* [Transforms QuestionnaireResponse based on Questionnaire Usage Variables socles into FHIR resources conforming to DM profiles](StructureMap-Q2FSL.md)
* [Alignement de l''expression de besoin vers le modèle physique du DPI dans le cadre de l''usage Core](StructureMap-CoreBusiness2Physical.md)
* [Cette ressource présente les spécifications de l''alignement entre les ressources FHIR vers les tables correspodantes du CDM OMOP.](StructureMap-CoreFHIR2OMOP.md)
* [Mapping FHIR Patient resource to OMOP Death](StructureMap-CoreFHIR2OMOPDeath.md)
* [Mapping Patient resource to Location OMOP Domain](StructureMap-CoreFHIR2OMOPLocation.md)
* [Mapping Observation laboratory resources to Measurement OMOP Domain](StructureMap-CoreFHIR2OMOPMeasurement.md)
* [Mapping FHIR Patient resource to OMOP Person](StructureMap-CoreFHIR2OMOPPerson.md)
* [Cette ressource présente les spécifications de l''alignement entre la ressource `Patient` vers les tables correspodantes du CDM OMOP.](StructureMap-CoreFHIRPatient2OMOP.md)
* [Alignement de l''usage Core du modèle physique du DPI vers les ressources FHIR](StructureMap-CorePhysical2FHIR.md)
* [Mapping simple Observation laboratory resources to Measurement OMOP Domain](StructureMap-CoreSimpleObservation2OMOPMeasurement.md)
* [DPI (local) Gender to HL7 Gender](ConceptMap-dpi-gender-2-hl7-gender.md)
* [DPI Encounter type to Semantic layer](ConceptMap-dpi-encounter-type-2-semantic-layer-encounter-class.md)
* [HL7 Gender to OHDSI Gender](ConceptMap-hl7-gender-to-ohdsi-gender.md)
* [Administration d'albumine de Madame Blanc](MedicationAdministration-albumine-j1-cas-9.md)
* [Administration à J1 de furosemide de Madame Blanc](MedicationAdministration-furosemide-j1-cas-9.md)
* [Administration à J1 de spironolactone de Madame Blanc](MedicationAdministration-spironolactone-j1-cas-9.md)
* [Administration à J2 de furosemide de Madame Blanc](MedicationAdministration-furosemide-j2-cas-9.md)
* [Administration à J2 de spironolactone de Madame Blanc](MedicationAdministration-spironolactone-j2-cas-9.md)
* [ALAT de Madame Blanc](Observation-alat-cas-9.md)
* [Albumine](Medication-albumine.md)
* [ASAT de Madame Blanc](Observation-asat-cas-9.md)
* [Ascite de Madame Blanc](Condition-ascite-cas-9.md)
* [Bilirubine totale de Madame Blanc](Observation-bilirubine-totale-cas-9.md)
* [Cirrhose de Madame Blanc](Condition-cirrhose-cas-9.md)
* [Consommation d'alcool de Madame Blanc](Observation-alcool-cas-9.md)
* [de Madame Blanc](Patient-cas-9.md)
* [Exemple complet (FSL)](Bundle-df9c9a9c-854b-46f4-9687-1fbe40c06540.md)
* [Exemple simple](QuestionnaireResponse-test-usage-core.md)
* [Fibroscopie oeso-gastroduodénale de Madame Blanc](Procedure-fogd-cas-9.md)
* [Furosémide](Medication-furosemide.md)
* [GGT de Madame Blanc](Observation-ggt-cas-9.md)
* [Patient 1 - Madame Dupont](QuestionnaireResponse-cas-1-usage-core.md)
* [Patient 10 - Monsieur David](QuestionnaireResponse-cas-10-usage-core.md)
* [Patient 11 - Madame Doré](QuestionnaireResponse-cas-11-usage-core.md)
* [Patient 2 - Monsieur Martin](QuestionnaireResponse-cas-2-usage-core.md)
* [Patient 3 - Madame Leroy](QuestionnaireResponse-cas-3-usage-core.md)
* [Patient 4 - Monsieur Moreau](QuestionnaireResponse-cas-4-usage-core.md)
* [Patient 5 - Madame Simon](QuestionnaireResponse-cas-5-usage-core.md)
* [Patient 6 - Monsieur Petit](QuestionnaireResponse-cas-6-usage-core.md)
* [Patient 7 - Madame Garcia](QuestionnaireResponse-cas-7-usage-core.md)
* [Patient 8 - Monsieur Roux](QuestionnaireResponse-cas-8-usage-core.md)
* [Patient 9 - Madame Blanc](QuestionnaireResponse-cas-9-usage-core.md)
* [Patient test (Bundle)](Bundle-5616f9ad-61b0-4279-9f41-777228d04665.md)
* [Patient test (Ressource)](Patient-8f005d60-b59b-47f7-b04a-f877378f8d68.md)
* [Phosphatases alcalines de Madame Blanc](Observation-phosphatases-alcalines-cas-9.md)
* [Poids de Madame Blanc](Observation-poids-cas-9.md)
* [Ponction évacuatrice de Madame Blanc](Procedure-ponction-cas-9.md)
* [Prescription d'albumine de Madame Blanc](MedicationRequest-albumine-cas-9.md)
* [Prescription de furosémide de Madame Blanc](MedicationRequest-furosemide-cas-9.md)
* [Prescription de furosémide de Madame Blanc](MedicationRequest-spironolactone-cas-9.md)
* [Spironolactone](Medication-spironolactone.md)
* [Séjour de Madame Blanc](Encounter-sejour-cas-9.md)
* [Taux de prothrombine de Madame Blanc](Observation-tp-cas-9.md)
* [Test simple](Bundle-2abf7f4c-bd1f-431f-a4c8-667cfa425baf.md)
* [Exigences des variables socles pour les Entrepôts de Données de Santé Hospitalier (EDSH)](DocumentReference-CoreExigences.md)

Data Management with FHIR
0.1.0 - ci-build

## Variables socles pour les EDSH

### Contexte

L'utilisation secondaire des données collectées dans le cadre des soins au sein des établissements de santé à des fins de recherche, d'études, d'évaluations ou encore de pilotage se développe rapidement en France. Cette tendance est notablement renforcée grâce à la mise en place d'entrepôts de données de santé (EDS). En harmonisant les efforts de collecte, de mise en qualité et de standardisation des données hospitalières vers un objectif commun, il devient possible de massifier la collecte de données d'intérêt et de concrétiser la consolidation d'un patrimoine national des données de santé. Cela favorise également le rapprochement de ces données de santé avec la base principale du Système National des Données de Santé.

Le groupe de travail mandaté en janvier 2023 par le comité stratégique des données de santé, constitué auprès des ministres chargés de la santé et de la recherche, propose à terme que l'ensemble des EDS hospitaliers du territoire national adopte un socle commun de 51 items. Ce socle permettra de caractériser l'ensemble des séjours et des patients, quels que soient les motifs de leur recours aux soins. Le socle est composé principalement des données les plus couramment collectées par les établissements dans le cadre des soins, notamment les données cliniques, médicamenteuses, les données socio-démographiques, ainsi que les résultats biologiques. Ces données sont généralement collectées de manière structurée et fiable au sein des systèmes d'information hospitaliers.

Dans le but d'engager efficacement les travaux d'intégration du socle au sein des EDS hospitaliers, celui-ci se divise en deux lots de données.

Le premier lot est composé d'items dont l'intégration est estimée comme prioritaire. Il s'agit de données essentiellement recueillies dans le cadre des soins, et dont la collecte au sein des systèmes d'information des hôpitaux est généralement structurée et fiable. Ce premier segment du socle comprend :

* Des données du PMSI collectées localement par les hôpitaux. Bien qu'elles soient déjà disponibles et consolidées à l'échelle nationale via la base principale du SNDS, le groupe de travail propose de capitaliser sur la collecte et les mécanismes de mise en qualité du PMSI déjà en place au sein des établissements. L'objectif est d'obtenir une caractérisation globale des patients et de leur séjour à l'hôpital au sein du socle. Le groupe de travail recommande donc l'inclusion d'un socle minimal de 9 items génériques collectés par les recueils PMSI dans les quatre "champs de soins de santé". 
 Initialement recueillies à des fins médico-administratives, la qualité des données du PMSI en fait désormais une source d'information largement utilisée pour la gestion des établissements, l'évaluation des parcours de soins, ainsi que pour la recherche. 
 Par conséquent, la collecte des données du PMSI doit être durable et indépendante du modèle de financement des hôpitaux.
* Des données socio-démographiques. Ces données complètent la caractérisation générale des patients par des données administratives qui ne sont pas collectées dans le cadre du PMSI. Parmi ces données, figurent les identifiants nationaux tels que le NIR, l'INS ou l'adresse géocodée. En tant que clés d'appariement direct, elles revêtent une importance primordiale pour rendre plus fiable et exhaustif le croisement des données cliniques collectées à l'hôpital avec d'autres bases de données nationales, notamment la base principale du SNDS, ainsi que des bases environnementales ou sociales (bases de données de la statistique publique). La mise en relation de ces données permettrait de promouvoir l'analyse des déterminants sociaux ou environnementaux de la santé, mesurés au moins à l'échelon collectif, sinon à un échelon individuel. 
 Actuellement, le traitement de ces données sensibles à des fins d'appariement suscite des interrogations légitimes pour les EDS conformes au référentiel sur les entrepôts de données de santé établi par la CNIL qui ne les autorise, ni ne les interdit explicitement.
* Les données de prescription et d'administration permettant de caractériser l'exposition médicamenteuse des patients. Ces données sont essentielles pour décrire les maladies et pour évaluer le rôle des médicaments comme déterminant de santé. 
 Ces données répondent à un besoin exprimé des utilisateurs pour améliorer la qualité des études en vie réelle en complétant les données médico-administratives de prescription et de délivrance en ville, disponibles dans la base principale du SNDS. 
 Disposer d'une vision globale de l'exposition médicamenteuse des patients sur l'ensemble de leur parcours de soins vise à améliorer l'évaluation des prises en charge des patients. 
 Le socle inclut les données relatives aux prescriptions et à l'administration des médicaments dans le milieu hospitalier quel que soit le type de traitement. A terme, le socle commun consolidera l'ensemble des informations concernant l'exposition médicamenteuse individuelle des patients à l'hôpital, ce qui constitue une évolution très favorable pour cette source d'information.
* Des résultats d'examens de biologie médicale. Élément majeur de la prise en charge des patients, contribuant au diagnostic, à apprécier la gravité ou le pronostic d'une maladie ou encore à évaluer la tolérance des produits de santé, les résultats des examens de biologie médicale ont un intérêt scientifique majeur. Les résultats de certains examens de biologie médicale réalisés à l'hôpital complètent les données relatives aux actes de dépistage et de diagnostic disponibles dans le PMSI. Étant donné la grande diversité des examens réalisables et le volume de données généré, le groupe de travail propose un socle minimal de 23 items, correspondant aux examens de routine, offrant une vision globale de l'état de santé du patient. Ces items incluent l'hémogramme, une caractérisation des fonctions rénale et hépatique et du bilan glycémique.
* Des données issues de l'examen clinique des patients. Des pratiques hétérogènes de collecte, privilégiant notamment une collecte de l'information au sein des comptes-rendus plutôt que dans les champs structurés alloués dans les logiciels métier, complique la collecte standardisée et leur utilisation secondaire. Le groupe de travail a néanmoins souhaité soutenir la collecte d'un nombre limité et prioritaire de données cliniques (taille, poids, pression artérielle) qui ne sont disponibles par ailleurs dans aucune grande base de données nationale en dehors d'enquêtes ponctuelles en population générale.

Un second lot de données comprend quatre items relatifs à des comportements à risque pour la santé, mesurés à l'échelle individuelle : consommation de tabac, consommation d'alcool, autres addictions, activité physique. Faisant partie des bonnes pratiques de soins et essentielles à la conduite d'études et d'évaluations dans le domaine de la santé, le recueil de ces données au sein des EDS reste aujourd'hui insuffisamment structuré pour une utilisation secondaire. Par ailleurs, selon la finalité de leur utilisation, les informations concernant ces comportements à risque pour la santé peuvent être collectées de différentes manières, que ce soit à l'échelon des unités médicales, des établissements de santé ou à l'échelle nationale. Cela rend l'interprétation de ces informations fortement dépendante du contexte de leur collecte. Leur collecte structurée et pérenne nécessite donc des travaux complémentaires, notamment en s'appuyant sur des définitions utilisées dans de grandes enquêtes européenne (par exemple, EHIS) ou nationale (par exemple, baromètre de Santé publique France), et en promouvant les travaux de comparaison, voire de généralisation des résultats issus des EDS hospitaliers, à la population française. Ce lot ne pourra donc pas être mis en œuvre simultanément avec la première partie du socle.

Enfin, le socle commun se compose d'informations généralement structurées à la source, mais les difficultés d'extraction de données depuis les systèmes d'information hospitaliers devront être considérées. En effet, certains éditeurs, sur la base de considérations liées aux droits de copyright et aux investissements à réaliser, choisissent de restreindre l'accès aux données, ce qui peut rendre l'extraction particulièrement complexe ou coûteuse pour les établissements, tout en limitant leur réutilisation au sein des EDS.

### Livrable du GT (n-1)

Les [exigences de l'usage **Variables socles pour les EDSH** (fichier MSExcel)](DocumentReference-CoreExigences.md) référencées issues des travaux du GT Standards & Interopérabilité.

> 
* [Processus de représentation d'un domaine de connaissance selon le format FHIR](use-core-variables-process.md)

